Journey of Aquaculture

  KLONING GEN Istilah kloning berasal dari kata “ clone” yang artinya potongan. Kloning gen dapat diartikan sebagai suatu proses yang digunakan untuk memanipulasi DNA dan kemudian dikembalikan pada organisme hidup untuk diekspresikan. Teknologi ini memampukan untuk mengisolasi DNA tertentu dari genom suatu organisme hidup, kemudian mentransformasinya menggunakan vektor pada suatu inang tau dalam pengertian lain kloning gen merupakan proses penggabungan gen target ke dalam   molekul DNA yang dapat bereplikasi sendiri (vector) dan proses amplifikasi menghasilkan DNA rekombinan pada sel inang yang sesuai (Mishra et al . 2014). Prinsip kloning DNA/gen yaitu memasukkan suatu DNA/gen tertentu ke dalam vector yang dapat bereplikasi sendiri di dalam sel inang (bakteri/kapang) sehingga menghasilkan kopi DNA/gen yang identik (Yatera et al . 2021). Kloning gen memiliki keterkaitan dengan DNA rekombinan. Proses DNA rekombinan meliputi isolasi DNA, pemotongan dan penyambungan DNA dan pe...

  EKSTRAKSI RNA             Ekstraksi atau isolasi asam nukleat dapat diartikan teknik dasar yang harus dikuasai dalam mempelajari teknik biologi molekular. Ekstraksi asam nukleat akan memisahkan asam nukleat dari komponen sel lainnya seperti protein, karbohidrat,   dan lemak sehingga asam nukleat yang diperoleh dapat dianalisis atau dimodifikasi lebih lanjut dengan teknik biologi molekular lainnya. Ekstraksi asam nukleat ini berguna untuk meneliti bahan yang bersifat mikro dengan alat-alat yang bersifat mikro. Terdapat dua metode ekstraksi asam nukleat yaitu ekstraksi DNA dan RNA. Kedua metode tersebut hampir mirip prosesnya, namun molekul RNA relatif pendek dan lebih sulit rusak dengan shearing sehingga disrupsi sel dapat dilakukan dengan lebih agresif. RNA atau Ribonucleic acid dapat diartikan sebagai materi genetik atau polimer nukleotida yang merupakan hasil transkripsi DNA yang ditranslasikan menjadi protein (Karu...

DNA SEKUENSING Informasi makhluk hidup terletak pada DNA. Informasi tersebu dapat diketahui melalui suatu tahapan yang disebut dengan   sekuensing DNA atau penentuan urutan basa. Sekuensing DNA dapat diartikan sebagai suatu proses atau teknik penentuan urutan basa nukleotida pada suatu segmen molekul DNA. Sekuens DNA merupakan informasi paling mendasar suatu gen atau genom karena mengandung instruksi yang dibutuhkan untuk pembentukan tubuh mahluk hidup (Mrozkin et al. 2012). Pengurutan ( sequencing ) asam nukleat memungkinkan untuk mengetahui kode genetik dari molekul DNA. Sekuensing DNA selanjutnya dapat dimanfaatkan untuk menentukan identitas dan fungsi dari suatu fragmen DNA dengan cara membandingkan sekuens-nya dengan sekuens DNA lain yang sudah diketahui (Lokapirnasari et al . 2017). Sekuensing DNA memiliki beberapa kegunaan seperti menentukan urutan basa nukleotida pada molekul primer DNA, menentukan hubungan kekerabatan ikan, mentransfer suatu gen ke dalam kromosom ikan ...

  DESAIN PRIMER             Bioinformatika sebagai gabungan ilmu komputer, matematika, biologi dan statistika berperan penting dalam mengatur dan menganalisis informasi biologis. Teknik analisis molekuler yang sudah banyak di gunakan hampir di seluruh dunia antara lain PCR, flow cytometry , tissue microarray , dan diagnosis genetik. PCR salah satu teknik yang paling banyak digunakan dan diterima secara luas untuk diagnosis yang membutuhkan spesifisitas hingga sensitivitas yang sangat tinggi. Kegunaan PCR dalam mendeteksi penyakit, kloning gen hingga komputasi DNA. Aspek yang paling penting untuk membuat alat PCR yang spesifik dan efisien adalah dengan mendesain primer. Primer dapat diartikan sebagai molekul oligonukleotida untai tunggal yang terdiri atas 28-30 basa. Desain primer sangat menentukan keberhasilan dalam sekuensing DNA.   Sekuen DNA primer akan digunakan dalam amplifikasi dengan metode PCR. Hasil sekuen gen y...

  BIOINFORMATIK Akuakultur telah tercatat sebagai industri penghasil makanan dengan perumbuhan paling cepat di dunia yang berkontribusi hingga 60-70%. Pertumbuhan akuakultur dipengaruhi oleh berbagai faktor. Kegiatan budidaya di bidang akuakultur tidak terlepas dari kecanggihan teknologi. Zaman yang semakin maju juga didukung oleh kemajuan ilmu pengetahuan. Ilmu pengetahuan dan teknologi yang semakin maju selalu berdampingan. Ilmu pengetahuan akan bernilai sia-sia jika tidak dapat memanfaatkan teknologi yang canggih begitu juga sebaliknya. Perkembangan teknologi di zaman sekarang ini merupakan pengaruh dari ledakan data dalam jumlah masif yang disebut dengan big data (Cahyo 2018). Data hasil penggabungan ilmu pengetahuan dan ilmu komputer biasanya diterapkan hampir di berbagai bidang ilmu termasuk ilmu biologi molekuler. Bentuk penerapan dari penggabungan ilmu pengetahuan dan komputer adalah bioinformatika. Bioinformatika dapat diartikan sebagai gabungan berbagai ilmu seperti ...

  ANALISIS EKSPRESI GEN SECARA REAL TIME PCR (QPCR) DAN SEMI KUANTITATIF             Ikan memiliki gen yang diekspresikan secara konstitutif pada seluruh atau beberapa jenis sel dan gen yang diekspresikan berbeda-beda bergantung pada kondisi yang dihadapi organisme. Ekspresi gen tersebut secara molekuler dapat dideteksi pada tahap transkripsi (mRNA) maupun translasi protein. Penggunaan PCR atau Polymerase Chain Reaction di lingkungan akuakultur telah banyak dilakukan. Metode PCR yang paling umum dikenal yaitu secara konvensional, namun terdapat juga metode PCR yang dinilai lebih akurat dalam mendeteksi suatu penyakit atau kekerabatan di lingkungan akuakultur yang disebut dengan Real-time PCR atau quantitative PCR (QPCR) dan semi kuantitatif (Dima et al . 2015). qPCR merupakan metode yang sensitiv untuk mendeteksi dan mengukur kualitas mRNA. Qpcr dapat diartikan sebagai teknis PCR yang mampu mendeteksi dan menyajikan perkem...

Hai teman-teman semua.. Apa kabar?  Semoga dalam keadaan sehat ya... Kali ini aku mau cerita tentang pengalaman aku diterima di kampus terbaik bangsa. Aku akan bagi menjadi beberapa sub, agar teman-teman mudah dalam memahaminya.  MASA SMA      Aku lahir dan besar di kota Medan. Aku menempuh pendidikan ku dari SD-SMA di kota Medan. Aku SMA di salah satu SMA negeri di kota Medan. Tapi, teman-teman tau ga, kalau SMA ku yang sekarang sebenarnya bukan SMA yang aku inginkan setelah tamat SMP. Tapi, karena permintaan orangtua ku supaya mudah buat mengawasi anaknya, akhirnya aku mengikuti permintaan orangtua ku dengan bersekolah disana. Awalnya, aku sedikit kesal karena banyak teman-teman SMP ku yang diterima di SMA favorit yang ku tuju. Aku benar-benar pasrah waktu itu dan berkata bahwa "Bukan sekolah tertentu yang menjamin kesuksesan seseorang, kalau tidak ada usaha juga sia-sia". Memang berat untuk menerima kenyataan tersebut, tapi mau gimana lagi kan yaa...  ...